1931年，著名爱国将领、云南省主席龙云先生在昆明创办南菁学校。南菁学校秉承“笃学、慎思、行端、履实” 校训，严谨治学，培养出大批栋梁英才，成为滇中名校。中科院院士庄育智、严陆光；两弹一星专家黄敞；清华、北大等名牌高校的教授陆祖荫、刘自强、黄敦；气象专家章淹、著名女作家宗璞；著名画家刘自鸣、云南省委原书记普朝柱、云南省教育厅原厅长张继康、云南省文化厅原厅长白祖诗，一大批南菁学子从南菁走出昆明，走出云南，走出中国，走向世界。

1945年，南菁学校地理教员、共产党员于再先生为反对内战争取和平，保护学生壮烈殉国，宋庆龄称其"为民先驱"。一代代南菁人继往开来，谱写了连绵92载兴教启智、育才强国的壮美诗篇！

1960年，南菁学校更名为昆明市第三十中学；1991年，学校恢复原名，两个校名同时使用至今，现为五华区教育体育局直属公办“云南省二级一等完全中学”。